Το Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα είναι διετές και χωρίζεται σε τέσσερα εξάμηνα. 

Η παρακολούθηση των µαθηµάτων είναι υποχρεωτική και η παρουσία και ενεργός συµµετοχή στο µάθηµα θα λαµβάνονται υπόψη κατά την βαθµολόγηση.

Η διεξαγωγή των μαθημάτων θα πραγματοποιείται κατά το Α' και Γ' εξάμηνο  στο Αμφιθέατρο του Π.Ν.Α. «Αρεταίειο» και κατά το Β' και Δ' εξάμηνο, αντίστοιχα, στο Αμφιθέατρο του Γ.Ν.Α. «Ιπποκράτειο».

Τα μαθήματα περιλαμβάνουν εργαστήρια, διαλέξεις, επιστημονικές ημερίδες, στρογγυλές τράπεζες, καθώς και πρακτική άσκηση, με την ενεργό συμμετοχή των σπουδαστών.

Κατά την έναρξη του ακαδημαϊκού εξαμήνου του ΠΜΣ, θα αναρτάται αναλυτικό πρόγραμμα των μαθημάτων, που ενδέχεται να τροποποιηθεί κατ΄ ανάγκη.